사장님 실무가이드

부가세 일반과세·간이과세 변경 시 재고 처리

2026.10.24 실무가이드 부가세

간이과세와 일반과세 사이에서 과세유형이 바뀌면 기존 재고·감가상각자산의 매입세액을 조정하는 문제가 생길 수 있습니다. 전환일 현재 재고와 자산을 실사하고 과거 증빙·공제 여부를 함께 확인해야 합니다.

과세유형 전환일 기준 재고·자산 목록과 과거 매입세액을 확인해 전환 조정 여부를 검토하세요.
전환 통지만 보고 매입세액을 자동으로 더하거나 빼지 마세요. 전환일 실사와 증빙이 필요합니다.

핵심 기준부터 확인하세요

전환일 현재 판매용 재고·원재료·제품과 사업용 감가상각자산을 나눠 목록화합니다. 취득일·취득가액·공제 여부·잔존가치를 확인해야 조정 가능성을 판단할 수 있습니다.

재고가 이미 판매됐거나 개인 사용·폐기된 경우는 전환일 현재 남은 자산과 다릅니다. 실사표와 처분자료를 함께 보관하세요.

자산	확인 항목	자료
상품·원재료	수량·취득일·잔량	재고실사·매입전표
시설·장비	취득가액·사용기간	자산대장·세금계산서
공제 여부	과거 과세유형·신고	이전 신고서
전환일	적용 시작일·실사일	통지·신청자료

과세유형 전환일 재고·자산을 숫자로 확인하는 예시

전환일 보유 항목	기록 예시	처리 확인
상품 재고	취득가액 110만원(부가세 10만원 포함), 전환일 잔량 40%	실사 수량·판매원장을 확인하고 재고매입세액 또는 재고납부세액 법정 산식에 대입
감가상각자산	냉장고 취득가액 1,100만원, 전환일 현재 사용 중	취득일·과거 공제액·사용기간·자산 종류를 확인해 조정 대상인지 검토
전환 전 판매분	전환일 직전 상품 66만원(부가세 포함) 판매	전환일 재고에서 제외하고 판매일 과세기간 신고와 매출원장을 대조
단순 비율 계산	과거 부가세 10만원 × 잔량 40% = 4만원	4만원은 설명용 산술일 뿐 실제 공제·납부액은 법정 산식과 승인 절차로 확정

간이과세자에서 일반과세자로 바뀌면 전환일 현재 재고품·감가상각자산을 신고하고 재고매입세액을 계산할 수 있으며, 반대 전환이면 재고납부세액이 문제될 수 있습니다. 국세법령정보시스템 과세유형 전환 재고매입세액 판례와 전환 신고서 양식을 기준으로 단순 비율을 실제 세액으로 오인하지 마세요.

비교 상황	예시	확인할 점
일반과세 적용 희망일	2026년 7월 1일부터 일반과세를 원함	포기신고서 제출 시점과 실제 적용일을 홈택스·세무서에서 확인
설비 매입	설비 공급가액 1,000만원·부가세 100만원	일반과세 전환 후 사업 관련 매입인지, 세금계산서 수취시기를 확인
매출 구조	월 과세 매출 600만원, 소비자 거래 중심	일반과세 매출세액·가격 표시와 간이과세 계산 결과를 같은 기간으로 비교
포기 후 기간	2026년 7월 1일부터 포기	적용받고자 한 날부터 3년이 되는 날이 속한 과세기간까지 일반과세 의무가 이어질 수 있음

휴업 중 지출	금액 예시	공제 검토
사업장 임차료	공급가액 100만원·부가세 10만원, 2개월 후 재영업 계획	임대차·재개 계획과 실제 사업장 유지 사실이 있으면 사업 관련성 검토
설비 수선	공급가액 200만원·부가세 20만원	재개 후 사용할 설비인지 수선계약·사진·재개일을 연결
개인 창고 사용	공급가액 100만원·부가세 10만원	사업장을 개인 보관공간으로 쓴 기간은 사업 관련성 부족으로 불공제 검토
재개 광고	공급가액 50만원·부가세 5만원	재개 예정 업종·광고 대상·계약기간을 남기고 실제 사업 전환 여부 확인

카드 거래	금액·일자 예시	신고 반영
폐업 전 매출	6월 30일 공급가액 100만원·부가세 10만원, 7월 5일 카드 입금	입금일이 늦어도 폐업 전 공급분으로 최종 신고하고 PG 정산서를 보관
폐업 전 주문 환불	6월 29일 11만원 승인, 7월 3일 전액 취소	원 승인번호·취소전표를 연결해 매출 감액 또는 수정 반영 검토
PG 수수료	총 카드매출 110만원, 수수료 3만3천원, 순입금 106만7천원	순입금만 매출로 잡지 말고 총매출과 수수료를 분리 기록
폐업 후 신규 주문	7월 1일 새 주문 55만원	폐업일 이후 공급인지 사업자 상태·공급일을 확인해 별도 조치

폐업일 재고	금액 예시	신고 전 확인
폐업 전 판매	공급가액 300만원, 부가세 30만원	판매일·세금계산서 또는 카드매출·정산일을 폐업 과세기간에 반영
잔존 상품	폐업일 시가 55만원(부가세 포함으로 가정)	매입세액 공제 여부와 자산 종류를 확인한 뒤 단순 계산상 5만원 세액 가능성을 검토
매입세액 불공제 재고	면세 매입 원재료 22만원	공제받지 않은 재화인지 증빙으로 확인하고 잔존재화 과세 여부를 구분
폐기 재고	유통기한 경과 식재료 11만원	품목·수량·폐기일·사진·폐기업체 자료를 남겨 실제 폐기 사실을 입증

양도 항목	금액 예시	확인할 처리
사업 전체 양도	재고 1,000만원·시설 2,000만원·임대차·인력 승계	권리·의무와 사업 동일성이 실제로 유지되는지 계약·인수목록으로 확인
재고만 매각	공급가액 500만원, 부가세 50만원	개별 재화 공급이면 세금계산서·공급시기·신고기간을 별도로 검토
시설 일부 매각	중고 장비 공급가액 300만원, 부가세 30만원	자산별 매각일·대금·세금계산서 발급 여부를 계약서와 대조
보증금·미수금	임대보증금 1,000만원, 기존 미수금 200만원	승계 여부와 양도 대상에서 제외되는 권리·의무를 계약서에 명시

거래	금액 예시	처리 기준
공동 매장 월매출	공급가액 2,000만원, 부가세 200만원	공동사업장 전체 매출세액으로 신고하고 개인 인출액으로 줄이지 않기
동업계약 지분	갑 60%, 을 40%	부가세 매출 2,000만원은 그대로 두고, 부가세 신고 후 소득·손익 배분 자료에 지분을 적용
공동 매입	공급가액 1,000만원, 부가세 100만원	사업장 명의 세금계산서와 사업 관련성을 확인해 매입세액 공제 검토
중도 탈퇴	6월 15일 탈퇴, 6월 16일 이후 단독 거래	효력일 전후 매출·매입·재고를 나누고 등록 정정과 정산합의서를 함께 보관

상황	금액 예시	신고 전 확인
본점과 지점이 별도 등록	본점 공급가액 1,000만원·부가세 100만원, 지점 500만원·부가세 50만원	각 사업장 매출·매입과 신고서를 따로 대조
사업자단위과세 등록	두 사업장 공급가액 합계 1,500만원, 매출세액 합계 150만원	본점에서 총괄 신고하더라도 사업장별 명세와 귀속자료를 보관
본점이 공용비용 결제	공용 매입 부가세 10만원, 본점 60%·지점 40%	임차계약·사용면적·배부표로 6만원과 4만원을 배분
재고를 지점으로 이동	본점 창고에서 지점으로 원가 330만원 이동	외부 판매인지 내부 이동인지 거래관계를 먼저 확인하고 중복 매출을 막기

비용 구분	계산 예시	신고 반영
면세 전용 교재	부가세 1만원, 면세 강의에만 사용	면세사업 관련 매입세액으로 전액 불공제
과세 전용 포장재	부가세 2만원, 과세 상품 판매에만 사용	사업 관련 증빙이 있으면 2만원 전액 공제 검토
공용 임차료	부가세 10만원, 과세 공간 65%·면세 공간 35%	6만5천원과 3만5천원을 나누고 면적·도면을 보관
공용 직원 시간	면세 업무 40시간, 과세 업무 60시간	근무표로 40%를 면세 관련으로 기록하고 공통분 산식을 설명

신고 전 처리 순서

과세유형 전환 적용일을 확인합니다.
전환일 현재 재고·자산을 실사합니다.
취득 증빙과 과거 신고·공제 여부를 연결합니다.
조정 대상과 제외 대상을 구분합니다.
전환 후 첫 신고서에 필요한 조정을 반영합니다.

실무자료와 자주 놓치는 부분

전환일 전에 판매된 재고를 전환일 재고로 포함하면 조정액이 틀립니다. 판매·반품·폐기 내역을 함께 확인하세요.

자산대장에 취득일·공제 여부가 없으면 전환 조정 근거가 약해집니다. 과거 세금계산서를 다시 모으세요.

과세유형 통지·신청서
전환일 재고실사표
자산대장
과거 매입세금계산서·신고서
처분·판매 자료

상황별 적용 예시

일반과세에서 간이과세로 전환된 매장이 전환일에 냉장고와 상품을 보유하고 있다면 각각 자산·재고의 취득·공제·잔량을 확인합니다.

전환 직전에 상품을 대량 판매했다면 실사표와 매출원장으로 전환일 잔량을 확정하세요.

검토자가 마지막에 묻는 질문

질문	답변에 필요한 근거
어느 과세기간 거래인가?	공급시기·인도·검수·정산일
누가 공급자·공급받는 자인가?	사업자등록·계약·세금계산서
금액은 총액인가 순액인가?	주문·수수료·환불·정산서
매입세액을 공제할 수 있나?	사업 관련성·불공제·증빙
수정이 필요하면 무엇을 고치나?	원본번호·수정사유·신고 영향
제출 후 상태를 확인했나?	접수증·납부·환급·거래처 반영

<p과세유형 전환일의 재고와 감가상각자산은 재고매입세액 또는 재고납부세액 대상인지 따로 계산해야 합니다.

공식 자료를 마지막으로 대조하세요

<p과세유형 변경일 현재 남은 재고와 감가상각자산은 재고매입세액 또는 재고납부세액 계산 대상인지 따져야 합니다. 전환일 재고목록·매입공제 자료를 정리해 국세법령정보시스템 과세유형 전환 재고매입세액 판례 기준과 홈택스 부가가치세 신고·조회 신고자료를 대조하세요.

많이 헷갈리는 질문

과세유형이 바뀌면 재고 매입세액을 다시 계산하나요?

전환일 재고·자산과 과거 공제 여부에 따라 조정 가능성을 검토합니다.

전환일 재고가 없으면 자료가 필요 없나요?

재고 없음과 자산 보유 여부를 실사·자산대장으로 확인해야 합니다.

과거 세금계산서를 못 찾으면 어떻게 하나요?

홈택스 매입자료·거래처 자료·장부를 대조해 보완하세요.